以圖形方式表示大量配對數據點的好方法是什麼？
在我的領域中，繪製成對數據的常用方法是一系列細斜線段，將其與兩組的中位數和 CI 重疊：
然而，隨著數據點的數量變得非常大（在我的情況下，我有大約 10000 對），這種圖變得更難閱讀：
降低 alpha 會有所幫助，但仍然不是很好。在尋找解決方案時，我遇到了這篇論文，並決定嘗試實現“平行線圖”。同樣，它適用於少量數據點：
但是當這種情節看起來不錯時，就更難了非常大：
我想我可以分別顯示兩組的分佈，例如使用箱線圖或小提琴，並在頂部繪製一條帶有誤差線的線，顯示兩個中位數/CI，但我真的不喜歡這個想法，因為它不會傳達數據的配對性質。
我也不太熱衷於 2D 散點圖的想法：我更喜歡更緊湊的表示形式，理想情況下，兩組的值沿同一軸繪製。為了完整起見，以下是二維散點圖的數據：
有誰知道用非常大的樣本量表示配對數據的更好方法？你能把我鏈接到一些例子嗎？
編輯
抱歉，我在解釋我在尋找什麼方面顯然做得不夠好。是的，2D 散點圖確實有效，並且有很多方法可以改進它以更好地傳達點的密度 - 我可以根據核密度估計對點進行顏色編碼，我可以製作 2D 直方圖，我可以在點等上面繪製輪廓，等等……
但是，我認為這對於我試圖傳達的信息來說太過分了。我並不真正關心顯示點本身的 2D 密度——我需要做的就是以盡可能簡單和清晰的方式表明“條”的值通常大於“點”的值，並且不會丟失數據的基本配對性質。理想情況下，我想沿著相同的而不是正交的軸繪製兩組的配對值，因為這樣可以更容易地在視覺上比較它們。
也許沒有比散點圖更好的選擇，但我想知道是否有任何可能的替代方案。
鑑於我對您的目標的理解，我只需計算成對差異（
bars - dots），然後在直方圖或核密度估計圖中繪製這些差異。您還可以添加 (1) 對應於零差異 (2) 任何百分位數選擇的垂直線的任意組合。這將突出顯示數據的哪些部分
bars超過dots，以及通常觀察到的差異是什麼。（我假設您對在同一圖中顯示 和 的實際原始值不感興趣。
bars）dots人們還可以繪製置信區間或後置可信區間，以表明這些差異是否顯著。（H/T @MrMeritology！）