Logistic

用二項式數據解釋廣義線性混合模型

  • January 14, 2020

我有一個帶有二項式響應數據的廣義線性混合模型,該模型:

model <- glmer(RespYN ~ Treatment + Gender + Length + (1 | Anim_ID),
 data = animDat,
 family = binomial(link = "logit"))

我不是統計學家(我是生物學家),所以我不知道如何解釋數據。我理解使用線性混合模型,由於平均差異等是響應變量的平均值。對於二項式 GLMM,我不確定。

我如何證明治療引起/不引起反應?

這是我的輸出(很抱歉傾倒了所有這些):

Generalized linear mixed model fit by maximum likelihood (Laplace Approximation) ['glmerMod']
Family: binomial  ( logit )
Formula: RespYN ~ Treatment + Gender + Length + (1 | Anim_ID)
  Data: animDat

    AIC      BIC   logLik deviance df.resid 
  142.1    158.1    -66.1    132.1      176 

Scaled residuals: 
   Min      1Q  Median      3Q     Max 
-2.6913 -0.3021 -0.2059  0.4435  3.8066 

Random effects:
Groups       Name        Variance Std.Dev.
Cockroach_ID (Intercept) 0        0       
Number of obs: 181, groups:  Cockroach_ID, 10

Fixed effects:
           Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept)  5.03046    3.62723   1.387    0.165    
TreatmentPo -4.06399    0.48900  -8.311   <2e-16 ***
GenderM      0.13323    0.49365   0.270    0.787    
Length      -0.05896    0.05758  -1.024    0.306    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

Correlation of Fixed Effects:
           (Intr) TrtmnP GendrM
TreatmentPo -0.175              
GenderM     -0.412 -0.039       
Length      -0.995  0.139  0.348
convergence code: 0

解釋與廣義線性模型相同,只是固定效應的估計取決於隨機效應。

由於這是一個廣義線性混合模型,係數估計的解釋方式與線性模型不同。在這種情況下,您有一個帶有 logit 鏈接的二元結果,因此原始估計值是對數賠率規模。截距的估計係數 5.03046是等於 0 RespYN時為 1(或編碼為任何非參考值)的對數機率,並取它們的參考值。d 的零值在您的樣本中可能沒有意義,因為它可能永遠不會是負數並且總是遠高於零,如果是這樣,您可能需要考慮將其居中,以便居中變量的零值更多有意義的。Length``Treatment``Gender``Length

-0.05896的估計值Length意味著與 0相比,增加 1 個單位Length與 1 的對數機率減少 0.05896 相關聯。如果我們對該數字取冪,則我們得到優勢比 0.9427445,這意味著對於增加 1 個單位,我們預計(大約)為1 的機率會降低 6%。RespYN``RespYN``Length``RespYN

對 -4.06399的估計TreatmentPo意味著Treatment= Po 與 0 相比,與其他治療組為RespYN1的對數機率低 4.06399 相關。RespYN這可以如上所述取冪以獲得優勢比。相同的分析適用於Gender

我如何證明治療引起/不引起反應?

統計數據無法證明任何事情,尤其是觀察性研究。您可以說,在控制GenderLength內的重複測量Anim_ID時,您已經發現證據表明Treatment與結果的關聯不為零。您也可以說,如果Treatment與結果的關聯實際上為零,那麼觀察您擁有的數據或更極端的數據的概率小於 0.0000000000000002

最後,我注意到您Anim_ID在模型公式中指定了隨機截距,但模型輸出表明這Cockroach_ID是分組變量。這很奇怪,通常它們是相同的。此外,收斂代碼為零,表示模型尚未收斂,隨機效應的估計方差為零。這意味著 . 內可能沒有變化Anim_IDglm()擬合一個模型(即沒有隨機截距但具有Anim_ID固定效應)並查看模型估計值的比較是一個好主意。

引用自:https://stats.stackexchange.com/questions/444797

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