組織 R 代碼和輸出的有效方法是什麼？[關閉]

我正在尋找有關其他人如何組織他們的 R 代碼和輸出的輸入。

我目前的做法是在文本文件中以塊的形式編寫代碼，如下所示：

#=================================================
# 19 May 2011
date()
# Correlation analysis of variables in sed summary
load("/media/working/working_files/R_working/sed_OM_survey.RData")
# correlation between estimated surface and mean perc.OM in epi samples
cor.test(survey$mean.perc.OM[survey$Depth == "epi"], 
   survey$est.surf.OM[survey$Depth   == "epi"]))
#==================================================

然後我將輸出粘貼到另一個文本文件中，通常帶有一些註釋。

這種方法的問題是：

1. 除了按日期外，代碼和輸出沒有明確鏈接。
2. 代碼和輸出是按時間順序組織的，因此很難搜索。

我考慮過用所有東西製作一個 Sweave 文檔，因為我可以製作一個目錄，但這似乎比它提供的好處更麻煩。

讓我知道您用於組織 R 代碼和輸出的任何有效例程，這些例程將允許有效地搜索和編輯分析。

你不是第一個問這個問題的人。

• 管理統計分析項目——指南和最佳實踐
• R 的工作流程
• R 工作流程：Jeromy Anglim 在墨爾本 R 用戶的演講中的幻燈片（包括另一個更長的專門用於 R 工作流程的網頁列表）
• 我自己的東西：使用 R 和 LATEX 作為可重複研究的重要組成部分的動態文檔
• 更多項目組織鏈接：如何高效管理統計分析項目？

引用自：https://stats.stackexchange.com/questions/10987