在R中，有用於 MCMC 的包和函數，例如jags.model允許我們控制要運行的鏈的數量，即在 內jags.model，我們可以設置n.chains = 4為鏈。生成的跟踪圖是多色的，因為它跟踪了四個獨立鏈的後驗估計。我的問題是，當我們從對像中檢索後驗圖或估計值時，哪個鍊子被使用了嗎？是平均值嗎？謝謝。
一般來說，每條鏈的老化迭代都被丟棄，其餘的迭代被簡單地組合起來，就像來自一個長鏈一樣。擁有獨立鏈的主要原因是為了更好地診斷收斂問題。
您可能還會發現這個問題很有幫助。
引用自：https://stats.stackexchange.com/questions/261539