Hypothesis-Testing

Fisher 精確檢驗假設什麼分佈?

  • December 30, 2014

在我的工作中,我看到了 Fisher 精確檢驗的多種用途,我想知道它與我的數據的匹配程度如何。查看了幾個來源,我了解瞭如何計算統計數據,但從未看到對假設的零假設的清晰和正式的解釋。

有人可以解釋或讓我參考假設分佈的正式解釋嗎?將不勝感激列聯表中的值的解釋。

在裡面如果分佈假設由兩個獨立的二項式隨機變量給出和. 原假設是等式. 但是Fisher精確檢驗是一個條件檢驗:它依賴於條件分佈給定. 此分佈是具有一個未知參數的超幾何分佈:優勢比,則原假設為.

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要使用 R 對其進行評估,您可以簡單地使用定義條件概率的公式:

p1 <- 7/27
p2 <- 14/70
x1 <- 7; n1 <- 27
x2 <- 14; n2 <- 56
# 
m <- x1+x2
dbinom(x1, n1, p1)*dbinom(x2, n2, p2)/sum(dbinom(0:m, n1, p1)*dbinom(m-(0:m), n2, p2))
[1] 0.1818838

或者使用包的dnoncenhypergeom功能MCMCpack

psi <- p1/(1-p1)/(p2/(1-p2)) # this is the odds ratio
MCMCpack::dnoncenhypergeom(x=x1, n1, n2, x1+x2, psi)
[1] 0.1818838

引用自:https://stats.stackexchange.com/questions/130695

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